0から始めるNGSデータ解析メモ
ノンプログラマーである実験研究者の備忘録
2014年8月11日月曜日
GEOのRAWデータをターミナルからダウンロード
あるアクセッション番号のRAWデータをダウンロードしたい時に、webのリンクからだと直接ダウンロードできないので、以下の様に自分のダウンロードしたい番号を入れる。親ディレクトリは下三桁をnnnとして、それより上の桁をダウンロードしたい番号と同じにする。
以下は例
wget ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/geo/series/
GSE11nnn
/
GSE11431
/suppl/
GSE11431
_RAW.tar
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