解析するプラットフォーム

やり方はいろいろあるようです。

1. GUIソフトで解析（例えば、CLCbio Genome Work bench )
• 比較的簡単。見た目にわかりやすい。パソコン普通に扱えればできそう。
• お金かかる。1ライセンス、60万程度。
• 導入されているプログラムしか使えない。
2. Macで解析 (Unix)
• OS Xを生かして、仮想環境無しで始められる。参考資料転がってそう。
• 緒方さんが作成した、お家でできるMac Bookでやる次世代シーケンスデータ解析がわかりやすい（http://www.ipad-zine.com/b/1520）
• PC性能に解析スピードが依存するので、比較的解析時間かかる。
3. Linuxで解析
• 仮想マシーン（Linuxに慣れるにはちょうどいい。virtual box・VM等）
• PC性能に解析スピードが依存するので、比較的解析時間かかる。
• サーバー → いわゆる本番環境（PC性能高いので解析スピードが早い。）
• サーバーが必要。→環境がないならお金かかる。
• セキュリティやサーバーの構築に知識が必要。
4. Galaxyで解析
• webベースのツールで必要なツールが大体そろっている。
• webでやるとuploadにやたら時間かかるときがある。
• 使いたいツールが使えない。
• サーバーにシステムごと導入できる。
• サーバーに一から導入するのは結構大変そう。

2, 3 (4も？）については以下の知識が必要と思われる。

• Unix/Linux
• ネットワーク（インターネット）
• ハードウェア

これらは、必要に応じて、少しずつ勉強していく。まずはLinuxのコマンドをざっと覚える。

幸いにもラボにサーバーが存在する事、基本的な構築が済んでおり管理者にUserアカウントを作成してもらえたので、すぐサーバーを使える！

サーバーを使うデメリットがだいぶ減ったので3-2の本番環境で始める事にした。

0から始めるっていう割には環境整ってるやん！
環境というよりも、解析した経験がゼロってことですね。